Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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SYCP1Q15431 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
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SYCP1Q15431 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
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SYCP1Q15431 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
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