Protein–RNA interactions for Protein: Q14957

GRIN2C, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2CQ14957 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GRIN2CQ14957 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GRIN2CQ14957 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GRIN2CQ14957 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
GRIN2CQ14957 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
GRIN2CQ14957 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
GRIN2CQ14957 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
GRIN2CQ14957 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
GRIN2CQ14957 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GRIN2CQ14957 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIN2CQ14957 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIN2CQ14957 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIN2CQ14957 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIN2CQ14957 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIN2CQ14957 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIN2CQ14957 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIN2CQ14957 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIN2CQ14957 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIN2CQ14957 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIN2CQ14957 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIN2CQ14957 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIN2CQ14957 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIN2CQ14957 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIN2CQ14957 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIN2CQ14957 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIN2CQ14957 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIN2CQ14957 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIN2CQ14957 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIN2CQ14957 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIN2CQ14957 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIN2CQ14957 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIN2CQ14957 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIN2CQ14957 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIN2CQ14957 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIN2CQ14957 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIN2CQ14957 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIN2CQ14957 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIN2CQ14957 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIN2CQ14957 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIN2CQ14957 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIN2CQ14957 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIN2CQ14957 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIN2CQ14957 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIN2CQ14957 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIN2CQ14957 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIN2CQ14957 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIN2CQ14957 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIN2CQ14957 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIN2CQ14957 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIN2CQ14957 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIN2CQ14957 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIN2CQ14957 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
GRIN2CQ14957 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
GRIN2CQ14957 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.7
GRIN2CQ14957 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
GRIN2CQ14957 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
GRIN2CQ14957 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
GRIN2CQ14957 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
GRIN2CQ14957 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
GRIN2CQ14957 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
GRIN2CQ14957 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.71
GRIN2CQ14957 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
GRIN2CQ14957 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
GRIN2CQ14957 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
GRIN2CQ14957 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
GRIN2CQ14957 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
GRIN2CQ14957 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
GRIN2CQ14957 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
GRIN2CQ14957 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
GRIN2CQ14957 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
GRIN2CQ14957 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
GRIN2CQ14957 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
GRIN2CQ14957 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
GRIN2CQ14957 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
GRIN2CQ14957 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
GRIN2CQ14957 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
GRIN2CQ14957 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
GRIN2CQ14957 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
GRIN2CQ14957 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
GRIN2CQ14957 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
GRIN2CQ14957 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
GRIN2CQ14957 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
GRIN2CQ14957 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
GRIN2CQ14957 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
GRIN2CQ14957 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
GRIN2CQ14957 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
GRIN2CQ14957 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
GRIN2CQ14957 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
GRIN2CQ14957 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
GRIN2CQ14957 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
GRIN2CQ14957 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
GRIN2CQ14957 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
GRIN2CQ14957 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
GRIN2CQ14957 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
GRIN2CQ14957 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
GRIN2CQ14957 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
GRIN2CQ14957 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
GRIN2CQ14957 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
GRIN2CQ14957 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
GRIN2CQ14957 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.4 ms