Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
COL4A6Q14031 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
COL4A6Q14031 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
COL4A6Q14031 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
COL4A6Q14031 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
COL4A6Q14031 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
COL4A6Q14031 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
COL4A6Q14031 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
COL4A6Q14031 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
COL4A6Q14031 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
COL4A6Q14031 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
COL4A6Q14031 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
COL4A6Q14031 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
COL4A6Q14031 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
COL4A6Q14031 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
COL4A6Q14031 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
COL4A6Q14031 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
COL4A6Q14031 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
COL4A6Q14031 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
COL4A6Q14031 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
COL4A6Q14031 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
COL4A6Q14031 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
COL4A6Q14031 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
COL4A6Q14031 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
COL4A6Q14031 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
COL4A6Q14031 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
COL4A6Q14031 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
COL4A6Q14031 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
COL4A6Q14031 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
COL4A6Q14031 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
COL4A6Q14031 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
COL4A6Q14031 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
COL4A6Q14031 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
COL4A6Q14031 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
COL4A6Q14031 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
COL4A6Q14031 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
COL4A6Q14031 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
COL4A6Q14031 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
COL4A6Q14031 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
COL4A6Q14031 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
COL4A6Q14031 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
COL4A6Q14031 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
COL4A6Q14031 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
COL4A6Q14031 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
COL4A6Q14031 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
COL4A6Q14031 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.6 ms