Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC1.49□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.49□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC1.48□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
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