Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
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