Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.6 ms