Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
CUL4AQ13619 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.4□□□□□ -2.03
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