Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
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TOP3AQ13472 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
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TOP3AQ13472 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
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TOP3AQ13472 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
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TOP3AQ13472 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
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TOP3AQ13472 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
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TOP3AQ13472 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
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