Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.9 ms