Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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CSTF3Q12996 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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