Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
TROQ12816 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
TROQ12816 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
TROQ12816 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
TROQ12816 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
TROQ12816 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
TROQ12816 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
TROQ12816 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
TROQ12816 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
TROQ12816 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
TROQ12816 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
TROQ12816 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
TROQ12816 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
TROQ12816 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
TROQ12816 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
TROQ12816 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
TROQ12816 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
TROQ12816 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
TROQ12816 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
TROQ12816 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
TROQ12816 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
TROQ12816 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
TROQ12816 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
TROQ12816 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
TROQ12816 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
TROQ12816 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
TROQ12816 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
TROQ12816 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
TROQ12816 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
TROQ12816 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
TROQ12816 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
TROQ12816 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
TROQ12816 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
TROQ12816 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
TROQ12816 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
TROQ12816 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC-0.21□□□□□ -2.44
TROQ12816 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
TROQ12816 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
TROQ12816 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
TROQ12816 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
TROQ12816 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
TROQ12816 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
TROQ12816 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
TROQ12816 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
TROQ12816 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.21□□□□□ -2.44
TROQ12816 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
TROQ12816 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
TROQ12816 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
TROQ12816 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
TROQ12816 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
TROQ12816 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
TROQ12816 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
TROQ12816 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
TROQ12816 MTCO3P17-201ENST00000443775 513 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
TROQ12816 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
TROQ12816 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
TROQ12816 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
TROQ12816 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
TROQ12816 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
TROQ12816 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
TROQ12816 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
TROQ12816 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
TROQ12816 AC098483.2-201ENST00000603158 454 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
TROQ12816 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
TROQ12816 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
TROQ12816 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
TROQ12816 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
TROQ12816 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
TROQ12816 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
TROQ12816 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
TROQ12816 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
TROQ12816 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
TROQ12816 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.45
TROQ12816 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
TROQ12816 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.45
TROQ12816 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
TROQ12816 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
TROQ12816 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
TROQ12816 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
TROQ12816 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
TROQ12816 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
TROQ12816 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
TROQ12816 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
TROQ12816 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
TROQ12816 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
TROQ12816 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
TROQ12816 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
TROQ12816 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
TROQ12816 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
TROQ12816 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
TROQ12816 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
TROQ12816 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
TROQ12816 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
TROQ12816 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
TROQ12816 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
TROQ12816 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
TROQ12816 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
TROQ12816 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
TROQ12816 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
TROQ12816 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
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