Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC0.84□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC0.84□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.28
HOXC5Q00444 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
HOXC5Q00444 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
HOXC5Q00444 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HOXC5Q00444 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HOXC5Q00444 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HOXC5Q00444 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HOXC5Q00444 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
HOXC5Q00444 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC0.83□□□□□ -2.28
HOXC5Q00444 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HOXC5Q00444 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
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HOXC5Q00444 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HOXC5Q00444 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HOXC5Q00444 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
HOXC5Q00444 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
HOXC5Q00444 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HOXC5Q00444 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HOXC5Q00444 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HOXC5Q00444 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
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HOXC5Q00444 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
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HOXC5Q00444 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HOXC5Q00444 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
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HOXC5Q00444 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
HOXC5Q00444 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
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HOXC5Q00444 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
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HOXC5Q00444 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HOXC5Q00444 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
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HOXC5Q00444 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HOXC5Q00444 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
HOXC5Q00444 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HOXC5Q00444 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HOXC5Q00444 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HOXC5Q00444 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
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