Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC2.1□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.5 ms