Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
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SNX13Q9Y5W8 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
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SNX13Q9Y5W8 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
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SNX13Q9Y5W8 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
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SNX13Q9Y5W8 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
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SNX13Q9Y5W8 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
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SNX13Q9Y5W8 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
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SNX13Q9Y5W8 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
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SNX13Q9Y5W8 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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SNX13Q9Y5W8 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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