Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
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USP18Q9UMW8 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
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