Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.5 ms