Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
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