Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
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TRIM63Q969Q1 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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TRIM63Q969Q1 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
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TRIM63Q969Q1 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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