Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD39Q53RE8 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD39Q53RE8 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD39Q53RE8 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD39Q53RE8 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD39Q53RE8 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD39Q53RE8 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD39Q53RE8 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD39Q53RE8 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD39Q53RE8 Z82198.3-201ENST00000421145 199 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD39Q53RE8 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD39Q53RE8 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD39Q53RE8 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD39Q53RE8 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD39Q53RE8 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD39Q53RE8 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD39Q53RE8 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD39Q53RE8 MIR6070-201ENST00000613967 103 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD39Q53RE8 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD39Q53RE8 MIR6736-201ENST00000616799 59 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD39Q53RE8 MIR6829-201ENST00000620375 67 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD39Q53RE8 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD39Q53RE8 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD39Q53RE8 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD39Q53RE8 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD39Q53RE8 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD39Q53RE8 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD39Q53RE8 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ANKRD39Q53RE8 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ANKRD39Q53RE8 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ANKRD39Q53RE8 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ANKRD39Q53RE8 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ANKRD39Q53RE8 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ANKRD39Q53RE8 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ANKRD39Q53RE8 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ANKRD39Q53RE8 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ANKRD39Q53RE8 AC002511.2-201ENST00000413796 450 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ANKRD39Q53RE8 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ANKRD39Q53RE8 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ANKRD39Q53RE8 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ANKRD39Q53RE8 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ANKRD39Q53RE8 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ANKRD39Q53RE8 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ANKRD39Q53RE8 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ANKRD39Q53RE8 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ANKRD39Q53RE8 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ANKRD39Q53RE8 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ANKRD39Q53RE8 AC211486.2-201ENST00000576046 280 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ANKRD39Q53RE8 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ANKRD39Q53RE8 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ANKRD39Q53RE8 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ANKRD39Q53RE8 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ANKRD39Q53RE8 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ANKRD39Q53RE8 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ANKRD39Q53RE8 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ANKRD39Q53RE8 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ANKRD39Q53RE8 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ANKRD39Q53RE8 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ANKRD39Q53RE8 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 RN7SL66P-201ENST00000582099 264 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 AC211486.4-201ENST00000621495 113 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
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