Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
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CDO1Q16878 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC2.18□□□□□ -2.06
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CDO1Q16878 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
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CDO1Q16878 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
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