Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
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SIX1Q15475 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
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SIX1Q15475 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
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SIX1Q15475 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
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