Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.7 ms