Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
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