Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.2 ms