Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
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SNX17Q15036 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
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SNX17Q15036 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
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SNX17Q15036 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
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