Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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