Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC1.88□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
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GPNMBQ14956 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
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GPNMBQ14956 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
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GPNMBQ14956 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
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GPNMBQ14956 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
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GPNMBQ14956 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
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GPNMBQ14956 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
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