Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
GBX1Q14549 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
GBX1Q14549 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
GBX1Q14549 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GBX1Q14549 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GBX1Q14549 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GBX1Q14549 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GBX1Q14549 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GBX1Q14549 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GBX1Q14549 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
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GBX1Q14549 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GBX1Q14549 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
GBX1Q14549 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
GBX1Q14549 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GBX1Q14549 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
GBX1Q14549 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GBX1Q14549 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GBX1Q14549 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
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GBX1Q14549 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GBX1Q14549 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
GBX1Q14549 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
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GBX1Q14549 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
GBX1Q14549 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
GBX1Q14549 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GBX1Q14549 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
GBX1Q14549 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
GBX1Q14549 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GBX1Q14549 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
GBX1Q14549 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GBX1Q14549 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GBX1Q14549 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
GBX1Q14549 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GBX1Q14549 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
GBX1Q14549 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GBX1Q14549 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
GBX1Q14549 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GBX1Q14549 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GBX1Q14549 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GBX1Q14549 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GBX1Q14549 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
GBX1Q14549 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
GBX1Q14549 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
GBX1Q14549 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
GBX1Q14549 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GBX1Q14549 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GBX1Q14549 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GBX1Q14549 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GBX1Q14549 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC3□□□□□ -1.93
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