Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.3 ms