Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC0.03□□□□□ -2.4
COL4A6Q14031 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
COL4A6Q14031 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
COL4A6Q14031 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
COL4A6Q14031 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
COL4A6Q14031 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
COL4A6Q14031 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
COL4A6Q14031 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
COL4A6Q14031 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
COL4A6Q14031 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.4
COL4A6Q14031 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
COL4A6Q14031 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
COL4A6Q14031 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
COL4A6Q14031 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
COL4A6Q14031 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
COL4A6Q14031 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC0.03□□□□□ -2.4
COL4A6Q14031 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC0.03□□□□□ -2.4
COL4A6Q14031 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC0.02□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC0.02□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC0.01□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC0.01□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC0.01□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC0□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC0□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC0□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC0□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC0□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC0□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC0□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC0□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC0□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC0□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC0□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC0□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC0□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC0□□□□□ -2.41
COL4A6Q14031 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.8 ms