Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PDE6HQ13956 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PDE6HQ13956 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PDE6HQ13956 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
PDE6HQ13956 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PDE6HQ13956 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PDE6HQ13956 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
PDE6HQ13956 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PDE6HQ13956 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PDE6HQ13956 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
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PDE6HQ13956 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PDE6HQ13956 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
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PDE6HQ13956 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
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PDE6HQ13956 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PDE6HQ13956 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PDE6HQ13956 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC0.6□□□□□ -2.31
PDE6HQ13956 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
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PDE6HQ13956 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC0.6□□□□□ -2.31
PDE6HQ13956 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PDE6HQ13956 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
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PDE6HQ13956 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
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PDE6HQ13956 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PDE6HQ13956 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
PDE6HQ13956 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PDE6HQ13956 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
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PDE6HQ13956 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.31
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PDE6HQ13956 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PDE6HQ13956 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PDE6HQ13956 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
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PDE6HQ13956 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.31
PDE6HQ13956 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.58□□□□□ -2.32
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PDE6HQ13956 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
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PDE6HQ13956 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.58□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
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