Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.5 ms