Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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