Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 RNU4-18P-201ENST00000516751 149 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ATRQ13535 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ATRQ13535 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ATRQ13535 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ATRQ13535 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC0□□□□□ -2.41
ATRQ13535 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC0□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ATRQ13535 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC0□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ATRQ13535 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC0□□□□□ -2.41
ATRQ13535 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ATRQ13535 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ATRQ13535 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC0□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ATRQ13535 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ATRQ13535 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ATRQ13535 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ATRQ13535 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ATRQ13535 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ATRQ13535 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ATRQ13535 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ATRQ13535 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ATRQ13535 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ATRQ13535 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ATRQ13535 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ATRQ13535 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC0□□□□□ -2.41
ATRQ13535 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC0□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC0□□□□□ -2.41
ATRQ13535 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ATRQ13535 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ATRQ13535 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ATRQ13535 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ATRQ13535 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC-0□□□□□ -2.41
ATRQ13535 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC-0□□□□□ -2.41
ATRQ13535 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC-0□□□□□ -2.41
ATRQ13535 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC-0□□□□□ -2.41
ATRQ13535 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0□□□□□ -2.41
ATRQ13535 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC-0□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC-0□□□□□ -2.41
ATRQ13535 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC-0□□□□□ -2.41
ATRQ13535 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC-0□□□□□ -2.41
ATRQ13535 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC-0□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC-0□□□□□ -2.41
ATRQ13535 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC-0□□□□□ -2.41
ATRQ13535 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC-0□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC-0□□□□□ -2.41
ATRQ13535 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
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