Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
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