Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
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GPS1Q13098 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
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GPS1Q13098 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
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GPS1Q13098 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
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GPS1Q13098 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
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GPS1Q13098 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
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GPS1Q13098 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
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GPS1Q13098 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
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GPS1Q13098 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
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