Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.8 ms