Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GRIK2Q13002 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.4 ms