Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
CHD3Q12873 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CHD3Q12873 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CHD3Q12873 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CHD3Q12873 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.31
CHD3Q12873 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CHD3Q12873 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CHD3Q12873 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CHD3Q12873 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CHD3Q12873 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CHD3Q12873 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CHD3Q12873 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.31
CHD3Q12873 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC0.59□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC0.58□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC0.58□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.58□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC0.57□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.57□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 BTBD7P2-201ENST00000441962 620 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC0.57□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC0.57□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.57□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC0.57□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC0.56□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC0.56□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.56□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CHD3Q12873 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC0.55□□□□□ -2.32
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