Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
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