Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXO1Q12778 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXO1Q12778 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXO1Q12778 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXO1Q12778 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXO1Q12778 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXO1Q12778 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXO1Q12778 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXO1Q12778 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXO1Q12778 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXO1Q12778 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXO1Q12778 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXO1Q12778 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXO1Q12778 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXO1Q12778 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXO1Q12778 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXO1Q12778 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXO1Q12778 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXO1Q12778 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXO1Q12778 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXO1Q12778 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXO1Q12778 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXO1Q12778 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXO1Q12778 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXO1Q12778 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXO1Q12778 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXO1Q12778 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXO1Q12778 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXO1Q12778 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXO1Q12778 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXO1Q12778 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXO1Q12778 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXO1Q12778 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXO1Q12778 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXO1Q12778 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXO1Q12778 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXO1Q12778 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXO1Q12778 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXO1Q12778 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXO1Q12778 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXO1Q12778 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXO1Q12778 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXO1Q12778 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXO1Q12778 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXO1Q12778 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXO1Q12778 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXO1Q12778 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXO1Q12778 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXO1Q12778 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXO1Q12778 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXO1Q12778 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXO1Q12778 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXO1Q12778 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXO1Q12778 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXO1Q12778 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXO1Q12778 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXO1Q12778 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXO1Q12778 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXO1Q12778 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXO1Q12778 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXO1Q12778 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXO1Q12778 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXO1Q12778 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXO1Q12778 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXO1Q12778 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXO1Q12778 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXO1Q12778 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXO1Q12778 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXO1Q12778 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXO1Q12778 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXO1Q12778 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXO1Q12778 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXO1Q12778 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXO1Q12778 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXO1Q12778 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXO1Q12778 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.7 ms