Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC2.1□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.1□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.1 ms