Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PGGT1BP53609 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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PGGT1BP53609 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PGGT1BP53609 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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PGGT1BP53609 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
PGGT1BP53609 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PGGT1BP53609 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PGGT1BP53609 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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