Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.3 ms