Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HOXD10P28358 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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