Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC2.14□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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