Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TPTE2P1-204ENST00000435256 593 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC-0.16□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC107905.1-201ENST00000616204 426 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC127540.1-201ENST00000580311 689 ntTSL 5 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
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