Protein–RNA interactions for Protein: Q99633

PRPF18, Pre-mRNA-splicing factor 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF18Q99633 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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PRPF18Q99633 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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PRPF18Q99633 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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