Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRIM63Q969Q1 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRIM63Q969Q1 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRIM63Q969Q1 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRIM63Q969Q1 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TRIM63Q969Q1 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TRIM63Q969Q1 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRIM63Q969Q1 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
TRIM63Q969Q1 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TRIM63Q969Q1 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
TRIM63Q969Q1 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TRIM63Q969Q1 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.3 ms