Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
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USP43Q70EL4 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
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USP43Q70EL4 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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USP43Q70EL4 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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USP43Q70EL4 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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USP43Q70EL4 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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USP43Q70EL4 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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